MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005231	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505776
2	NC_005231	TTG	2	6	1992	1997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505776
3	NC_005231	AGT	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505776
4	NC_005231	TGA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505776
5	NC_005231	CAACT	2	10	2436	2445	40 %	20 %	0 %	40 %	38505776
6	NC_005231	C	6	6	2602	2607	0 %	0 %	0 %	100 %	38505776
7	NC_005231	G	6	6	2622	2627	0 %	0 %	100 %	0 %	38505776
8	NC_005231	ATC	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505776
9	NC_005231	TTGG	2	8	2728	2735	0 %	50 %	50 %	0 %	38505776
10	NC_005231	TGA	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505776
11	NC_005231	CA	3	6	2895	2900	50 %	0 %	0 %	50 %	38505776
12	NC_005231	TCT	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505776
13	NC_005231	TCC	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505777
14	NC_005231	CCA	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505777
15	NC_005231	CTGC	2	8	3129	3136	0 %	25 %	25 %	50 %	38505777
16	NC_005231	CGG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505777
17	NC_005231	GTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505777
18	NC_005231	AAT	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505777
19	NC_005231	TCC	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505777
20	NC_005231	ACA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505777
21	NC_005231	CA	3	6	3412	3417	50 %	0 %	0 %	50 %	38505777
22	NC_005231	CCG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505777
23	NC_005231	GA	3	6	3519	3524	50 %	0 %	50 %	0 %	38505777
24	NC_005231	CGC	2	6	3526	3531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505777
25	NC_005231	CAC	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505777
26	NC_005231	AAT	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505777
27	NC_005231	TTC	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505777
28	NC_005231	TTC	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505778
29	NC_005231	TCT	3	9	3793	3801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505778
30	NC_005231	CCT	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505779
31	NC_005231	TAA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505779
32	NC_005231	TCA	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505779
33	NC_005231	AG	3	6	3919	3924	50 %	0 %	50 %	0 %	38505779
34	NC_005231	CGG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505779
35	NC_005231	CGG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505779
36	NC_005231	ATG	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505779
37	NC_005231	C	6	6	3986	3991	0 %	0 %	0 %	100 %	38505779
38	NC_005231	TAG	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505779
39	NC_005231	GAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505779
40	NC_005231	AGA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505779
41	NC_005231	GCG	2	6	4233	4238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505779
42	NC_005231	TTC	2	6	4289	4294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505779
43	NC_005231	GGT	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505779
44	NC_005231	GAT	3	9	4331	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505779
45	NC_005231	T	8	8	4343	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	38505779
46	NC_005231	AT	3	6	4371	4376	50 %	50 %	0 %	0 %	38505779
47	NC_005231	TC	3	6	4377	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	38505779
48	NC_005231	CAA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505780
49	NC_005231	TCC	3	9	4659	4667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505781
50	NC_005231	TCA	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505781
51	NC_005231	CCA	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505781
52	NC_005231	AGG	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505781
53	NC_005231	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505781
54	NC_005231	TGT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
55	NC_005231	TTGC	2	8	4885	4892	0 %	50 %	25 %	25 %	38505781
56	NC_005231	TGG	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505781
57	NC_005231	AAT	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
58	NC_005231	AAC	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505781
59	NC_005231	A	6	6	5340	5345	100 %	0 %	0 %	0 %	38505781
60	NC_005231	TGA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505781
61	NC_005231	AGT	2	6	5460	5465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505781
62	NC_005231	GCC	2	6	5473	5478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505781
63	NC_005231	TTG	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
64	NC_005231	TTG	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
65	NC_005231	ATTG	2	8	5514	5521	25 %	50 %	25 %	0 %	38505781
66	NC_005231	TTG	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
67	NC_005231	TGG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505781
68	NC_005231	AGA	2	6	5565	5570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505781
69	NC_005231	TAA	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
70	NC_005231	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505781
71	NC_005231	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
72	NC_005231	TAA	2	6	5791	5796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
73	NC_005231	GGT	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505781
74	NC_005231	TTCC	2	8	5933	5940	0 %	50 %	0 %	50 %	38505781
75	NC_005231	CAA	2	6	6084	6089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505782
76	NC_005231	CTG	2	6	6211	6216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505782
77	NC_005231	CCT	2	6	6258	6263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505782
78	NC_005231	TCA	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505782
79	NC_005231	CAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505782
80	NC_005231	G	6	6	6363	6368	0 %	0 %	100 %	0 %	38505782
81	NC_005231	TCA	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505782
82	NC_005231	CGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505783
83	NC_005231	C	6	6	6552	6557	0 %	0 %	0 %	100 %	38505783
84	NC_005231	CAA	2	6	6663	6668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505784
85	NC_005231	CAA	2	6	6676	6681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505784
86	NC_005231	TCC	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
87	NC_005231	AAC	2	6	6875	6880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505784
88	NC_005231	CCA	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505784
89	NC_005231	CA	3	6	6928	6933	50 %	0 %	0 %	50 %	38505784
90	NC_005231	GCC	2	6	6940	6945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505784
91	NC_005231	CTT	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
92	NC_005231	TCT	2	6	7002	7007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
93	NC_005231	CTT	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
94	NC_005231	CGG	2	6	7065	7070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505784
95	NC_005231	ACC	2	6	7190	7195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505784
96	NC_005231	TTC	2	6	7238	7243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
97	NC_005231	CTC	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
98	NC_005231	AGA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505784
99	NC_005231	GCG	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505784
100	NC_005231	GAC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505784
101	NC_005231	ATC	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505784
102	NC_005231	C	6	6	7646	7651	0 %	0 %	0 %	100 %	38505784
103	NC_005231	AGTC	2	8	7662	7669	25 %	25 %	25 %	25 %	38505784
104	NC_005231	AGG	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505784
105	NC_005231	AG	3	6	7696	7701	50 %	0 %	50 %	0 %	38505784
106	NC_005231	CAG	2	6	7789	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505784
107	NC_005231	CCT	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
108	NC_005231	CCT	2	6	7860	7865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
109	NC_005231	CTC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
110	NC_005231	C	6	6	7918	7923	0 %	0 %	0 %	100 %	38505784
111	NC_005231	G	6	6	8022	8027	0 %	0 %	100 %	0 %	38505784
112	NC_005231	GTT	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505784
113	NC_005231	GCG	2	6	8068	8073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505784
114	NC_005231	GAC	2	6	8493	8498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505785
115	NC_005231	TGT	3	9	8595	8603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505785
116	NC_005231	CAG	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505786
117	NC_005231	GGC	2	6	8921	8926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505786
118	NC_005231	ATA	2	6	8948	8953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505786
119	NC_005231	T	6	6	9006	9011	0 %	100 %	0 %	0 %	38505786
120	NC_005231	GTG	2	6	9041	9046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505786
121	NC_005231	CCCT	2	8	9088	9095	0 %	25 %	0 %	75 %	38505786
122	NC_005231	AT	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	38505786
123	NC_005231	TAA	2	6	9138	9143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505786
124	NC_005231	CTG	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505786
125	NC_005231	CCA	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505786
126	NC_005231	T	6	6	9369	9374	0 %	100 %	0 %	0 %	38505787
127	NC_005231	GAC	2	6	9450	9455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505787
128	NC_005231	CTG	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505787
129	NC_005231	TTC	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505787
130	NC_005231	GGT	2	6	9526	9531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505787
131	NC_005231	TCGT	2	8	9574	9581	0 %	50 %	25 %	25 %	38505787
132	NC_005231	ACT	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505787
133	NC_005231	GAAG	2	8	9760	9767	50 %	0 %	50 %	0 %	38505788
134	NC_005231	CCG	2	6	9828	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505788
135	NC_005231	ACTT	2	8	9982	9989	25 %	50 %	0 %	25 %	38505789
136	NC_005231	AG	4	8	9992	9999	50 %	0 %	50 %	0 %	38505789
137	NC_005231	GAA	2	6	10011	10016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505789
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266	NC_005231	GCC	2	6	20700	20705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505798
267	NC_005231	GTA	2	6	20716	20721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505798
268	NC_005231	TGT	2	6	20794	20799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505798
269	NC_005231	TGG	2	6	20809	20814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505798
270	NC_005231	GGTT	2	8	20817	20824	0 %	50 %	50 %	0 %	38505798
271	NC_005231	AGA	2	6	20948	20953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505798
272	NC_005231	TGA	2	6	21001	21006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505798
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275	NC_005231	GAC	2	6	21176	21181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505798
276	NC_005231	ACA	2	6	21235	21240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505798
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279	NC_005231	GCA	2	6	21442	21447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505799
280	NC_005231	ATG	2	6	21501	21506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505799
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289	NC_005231	CAGC	2	8	22293	22300	25 %	0 %	25 %	50 %	38505800
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291	NC_005231	GTTG	2	8	22748	22755	0 %	50 %	50 %	0 %	38505801
292	NC_005231	CGA	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505801
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294	NC_005231	GTTG	2	8	22820	22827	0 %	50 %	50 %	0 %	38505801
295	NC_005231	AG	3	6	22828	22833	50 %	0 %	50 %	0 %	38505801
296	NC_005231	AGA	2	6	22894	22899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505801
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300	NC_005231	AACAA	2	10	23462	23471	80 %	0 %	0 %	20 %	38505802
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302	NC_005231	A	6	6	23564	23569	100 %	0 %	0 %	0 %	38505802
303	NC_005231	CGG	2	6	23605	23610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505802
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321	NC_005231	AT	3	6	24814	24819	50 %	50 %	0 %	0 %	38505804
322	NC_005231	TGGTC	2	10	25148	25157	0 %	40 %	40 %	20 %	38505805
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335	NC_005231	CT	3	6	25670	25675	0 %	50 %	0 %	50 %	38505805
336	NC_005231	ATT	2	6	25805	25810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505805
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397	NC_005231	GTA	2	6	29323	29328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505809
398	NC_005231	GGT	2	6	29366	29371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505809
399	NC_005231	CAC	2	6	29399	29404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505809
400	NC_005231	CTT	2	6	29434	29439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505809
401	NC_005231	CAC	2	6	29463	29468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505809
402	NC_005231	GCC	2	6	29493	29498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505809
403	NC_005231	CGG	2	6	29527	29532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505809
404	NC_005231	GCA	2	6	29572	29577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505809
405	NC_005231	GCC	2	6	29609	29614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505809
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415	NC_005231	CAG	2	6	29983	29988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505809
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420	NC_005231	CGG	2	6	30251	30256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505810
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431	NC_005231	T	6	6	31521	31526	0 %	100 %	0 %	0 %	38505812
432	NC_005231	GCT	2	6	31561	31566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505812
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435	NC_005231	CCA	2	6	31629	31634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505812
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437	NC_005231	GGC	2	6	31782	31787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505812
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440	NC_005231	TAAT	2	8	32021	32028	50 %	50 %	0 %	0 %	38505812
441	NC_005231	GCA	2	6	32031	32036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505812
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464	NC_005231	A	7	7	33238	33244	100 %	0 %	0 %	0 %	38505813
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470	NC_005231	TCA	2	6	33579	33584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505813
471	NC_005231	CAA	2	6	33736	33741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505813
472	NC_005231	GCTATA	2	12	33758	33769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505813
473	NC_005231	CCA	3	9	33794	33802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505813
474	NC_005231	ATTT	2	8	33809	33816	25 %	75 %	0 %	0 %	38505813
475	NC_005231	CGC	2	6	33871	33876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505813
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478	NC_005231	C	6	6	33988	33993	0 %	0 %	0 %	100 %	38505813
479	NC_005231	CGCTG	2	10	34028	34037	0 %	20 %	40 %	40 %	38505813
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482	NC_005231	TCCCC	2	10	34262	34271	0 %	20 %	0 %	80 %	38505813
483	NC_005231	GCA	2	6	34284	34289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505813
484	NC_005231	GGTA	2	8	34341	34348	25 %	25 %	50 %	0 %	38505813
485	NC_005231	GTA	2	6	34505	34510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505813
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487	NC_005231	CGA	2	6	34557	34562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505813
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490	NC_005231	CCT	2	6	34917	34922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505813
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492	NC_005231	CTGG	2	8	35166	35173	0 %	25 %	50 %	25 %	38505813
493	NC_005231	ATG	2	6	35186	35191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505813
494	NC_005231	ACCA	2	8	35285	35292	50 %	0 %	0 %	50 %	38505813
495	NC_005231	ATC	2	6	35296	35301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505813
496	NC_005231	GTG	2	6	35303	35308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505813
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498	NC_005231	GCCCCC	2	12	35398	35409	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	38505813
499	NC_005231	CGA	2	6	35436	35441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505813
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